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“新冠”肺炎疫情發(fā)酵,,加速了醫(yī)療信息化的發(fā)展;病毒形態(tài)分析,、疫苗研發(fā)也從科學(xué)研究領(lǐng)域話題演變?yōu)榇蟊婈P(guān)心的民生話題,,生物基因數(shù)據(jù)價值愈加凸顯。同時,,為提高診斷效率,,國家允許符合條件的第三方機構(gòu)開展核酸檢測,獨立實驗室的重要性又一次顯現(xiàn),。

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日前,,全球生命科學(xué)領(lǐng)域首個綜合性的大科學(xué)裝置——國家蛋白質(zhì)科學(xué)研究(上海)設(shè)施,開通了支持新冠肺炎病毒相關(guān)研究的快捷綠色通道,。

曙光通過為國家蛋白質(zhì)科學(xué)研究(上海)設(shè)施搭建的“醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)設(shè)施-信息系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺”,,為其研究新冠肺炎病毒相關(guān)蛋白的晶體結(jié)構(gòu)、核磁和冷凍電鏡數(shù)據(jù)的采集與分析以及病毒形態(tài)學(xué)檢測等項目提供了支撐,;全力支持與新冠肺炎病毒相關(guān)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與致病機理研究,、快速檢測技術(shù)產(chǎn)品研發(fā)以及抗病毒藥物和疫苗研發(fā)等工作。

解碼生物數(shù)據(jù)應(yīng)用“新要求”

生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施深刻體現(xiàn)前沿信息技術(shù)與現(xiàn)代生命科學(xué)的交叉,。除了病毒形態(tài)研究以外,,我們也看到了精準醫(yī)療,、個性化醫(yī)療的未來發(fā)展趨勢,。

由曙光公司為國家蛋白質(zhì)科學(xué)研究(上海)搭建的“醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)設(shè)施-信息系統(tǒng)基礎(chǔ)平臺”,以患者生理生化指標,,器官影像檢查,、家族遺傳背景等多維度的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),結(jié)合基因組測序,、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等各種先進組學(xué)檢測等技術(shù),,通過生物信息學(xué)手段進行綜合數(shù)據(jù)分析和挖掘,提供與疾病診斷和治療相關(guān)的遺傳和臨床信息,。形成特征數(shù)據(jù)后,,再通過機器深度學(xué)習(xí)和人工智能等方法,實現(xiàn)真正意義上的精準分析,、輔助診斷和個性化醫(yī)療,。

多年積累,應(yīng)對生物數(shù)據(jù)“海量”與“多變”

在對海量生物數(shù)據(jù)中的深刻規(guī)律進行研究時,曙光發(fā)現(xiàn),,必須保證數(shù)據(jù)的3特征,,即數(shù)據(jù)量大,處理數(shù)據(jù)效率高,,數(shù)據(jù)源要有多變性,。借助這些特點,才可以實現(xiàn)大數(shù)據(jù)的分析和預(yù)測,。

基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)以每12-18個月10倍的速度快速增長,。針對海量數(shù)據(jù),曙光ParaStor分布式存儲系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長,,滿足存儲系統(tǒng)對數(shù)據(jù)處理能力和擴展性的要求,。通過系列先進技術(shù),曙光ParaStor分布式存儲系統(tǒng)消除擴展存儲架構(gòu)的性能局限性,,解決生物基因應(yīng)用中對數(shù)據(jù)處理效率和數(shù)據(jù)多變性的需求,。

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抓住“新趨勢”,持續(xù)深耕生物基因領(lǐng)域

生命科學(xué)對于疫情的幫助,,不僅限于分子生物學(xué)診斷以及毒株鑒定,,疫苗生產(chǎn),還包括預(yù)防醫(yī)學(xué),,流行病學(xué)等,。因此,疫情過后,,分子診斷,、基因測序、第三方醫(yī)學(xué)實驗室也將逆勢成長,,生物基因與信息技術(shù)的融合也將更緊密,。

多年來,曙光公司深耕生物基因領(lǐng)域,,為上海瑞金醫(yī)院,、北京天壇醫(yī)院、北京基因組研究所,、上海生命科學(xué)研究院,、上海市疾病預(yù)防控制中心等單位提供產(chǎn)品與解決方案,支持醫(yī)療影像,、基因測序,、冷凍電鏡、藥品研發(fā)等應(yīng)用的穩(wěn)定運行,。未來,,曙光也將不斷提供創(chuàng)新的技術(shù)與產(chǎn)品,,為生物基因技術(shù)的快速發(fā)展發(fā)揮重要作用。

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